Το μικροβίωμα του εντέρου, η κοινότητα των μικροοργανισμών που ζουν στο παχύ έντερο, μπορεί να διαμορφώσει τον κίνδυνο ενός ατόμου να αναπτύξει χρόνιες ασθένειες, όπως ο διαβήτης τύπου 2 και οι καρδιακές παθήσεις.
Τώρα, οι επιστήμονες έχουν αναπτύξει ένα υπολογιστικό εργαλείο που λένε ότι μπορεί να αποκαλύψει πόσο «υγιές» είναι το μικροβίωμα του εντέρου ενός ατόμου, χρησιμοποιώντας δεδομένα από ένα μόνο δείγμα κοπράνων.
Αν και η ιδέα είναι ενδιαφέρουσα, οι ειδικοί είπαν στο Live Science ότι έχουν επιφυλάξεις σχετικά με το πόσο χρήσιμο θα ήταν πραγματικά το νέο εργαλείο για τους ασθενείς.
Τι διαδικασία θα ακολουθεί σε επίπεδο εύρεσης νέων δεδομέnων για το μικροβίωμα;
Το εργαλείο, που ονομάζεται Gut Microbiome Wellness Index 2 (GMWI2), δίνει στους χρήστες βαθμολογία μεταξύ -6 και +6. Όσο υψηλότερη είναι η βαθμολογία, τόσο πιο «υγιές» είναι το εντερικό τους μικροβίωμα και το αντίστροφο.
Σε μια πρόσφατη μελέτη, που δημοσιεύτηκε στις 28 Αυγούστου στο περιοδικό Nature Communications , οι ερευνητές διαπίστωσαν ότι το GMWI2 ήταν 80% ακριβές στη διαφοροποίηση μεταξύ ενός «υγιούς» μικροβιώματος του εντέρου, στο θετικό άκρο του φάσματος, και ενός «ανθυγιεινού» το αντίθετο άκρο.
Το εργαλείο εκπαιδεύτηκε σε δείγματα κοπράνων από 8.000 άτομα και στη συνέχεια δοκιμάστηκε σε δείγματα 1.140 ατόμων.
Οποιοσδήποτε μπορεί να κατεβάσει και να χρησιμοποιήσει ελεύθερα το GMWI2, αλλά θα χρειαστεί ένα «βασικό υπόβαθρο επιστήμης υπολογιστών ή βιοπληροφορικής» για να ερμηνεύσει τα αποτελέσματα, δήλωσε στο Live Science ο Jaeyun Sung, επίκουρος καθηγητής χειρουργικής στην Κλινική Mayo στη Μινεσότα.
Η ομάδα ελπίζει ότι τελικά, οποιοσδήποτε θα μπορέσει να λάβει βαθμολογία υγείας του εντέρου από την τοπική κλινική του παρέχοντας ένα δείγμα κοπράνων, είπε ο Sung.
Ωστόσο, άλλοι ειδικοί έχουν εκφράσει ανησυχίες σχετικά με την πιθανή χρησιμότητα ενός τέτοιου εργαλείου. Αναρωτιούνται τι σημαίνει να έχεις ένα «υγιές» μικροβίωμα του εντέρου σε αυτό το πλαίσιο και ποιος μπορεί να επωφεληθεί από την εκμάθηση του δείκτη υγείας του εντέρου του.
Ορισμός του «υγιούς»
Το GMWI2 βασίζεται σε έναν τύπο μηχανικής μάθησης, ένα εργαλείο τεχνητής νοημοσύνης (AI) που μπορεί να κάνει προβλέψεις για ένα κομμάτι δεδομένων με βάση ένα σύνολο κανόνων που έχει εκπαιδευτεί να ακολουθεί.
Συνήθως, οι επιστήμονες «εκπαιδεύουν» την τεχνητή νοημοσύνη παρέχοντας θησαυρούς δεδομένων από έναν δεδομένο πληθυσμό και, στη συνέχεια, μόλις βρει κοινά μοτίβα σε αυτά τα δεδομένα, το εργαλείο μπορεί να κάνει προβλέψεις για νέα δεδομένα από διαφορετική ομάδα ανθρώπων.
Σε αυτή την περίπτωση, οι ερευνητές εκπαίδευσαν το GMWI2 να εντοπίζει συγκεκριμένα χαρακτηριστικά των μικροβιωμάτων του εντέρου των ανθρώπων που πάσχουν από μια ασθένεια – ας πούμε, διαβήτη – και να τα συγκρίνουν με τα μικροβιώματα του εντέρου ατόμων χωρίς αυτήν την πάθηση.
Αυτό το έκαναν τροφοδοτώντας του δεδομένα σχετικά με το μείγμα μικροβίων που βρέθηκαν στα δείγματα κοπράνων από περίπου 8.000 ανθρώπους από 26 χώρες σε έξι ηπείρους.
Περίπου 5.500 από αυτά τα άτομα είχαν προηγουμένως διαγνωστεί με μία από τις 11 ασθένειες, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του παχέος εντέρου και της φλεγμονώδους νόσου του εντέρου, της νόσου του Crohn .
Τα υπόλοιπα 2.500 άτομα δεν είχαν διάγνωση καμίας από τις 11 καταστάσεις. Αφού εκπαίδευσαν το εργαλείο με αυτά τα δεδομένα, οι ερευνητές εξέτασαν πόσο καλά λειτουργούσε σε άλλα 1.140 δείγματα κοπράνων από ασθενείς που είτε είχαν διαγνωστεί με ασθένειες, όπως ο καρκίνος του παγκρέατος και η νόσος του Πάρκινσον, είτε όχι.
Οι ερευνητές διαπίστωσαν ότι όσο υψηλότερη είναι η βαθμολογία GMWI2 ενός ατόμου, τόσο περισσότερο το μικροβίωμα του εντέρου του μοιάζει με αυτό κάποιου που δεν έχει μία από αυτές τις ασθένειες. Μια χαμηλότερη βαθμολογία υποδηλώνει το αντίθετο – ότι το μικροβίωμα του εντέρου τους φαίνεται διαφορετικό από αυτό ενός ατόμου με οποιαδήποτε από αυτές τις παθήσεις.
Τεχνολογική καινοτομία
Σε αντίθεση με τα καθιερωμένα διαγνωστικά εργαλεία, όπως οι κολονοσκοπήσεις για τον καρκίνο του παχέος εντέρου, το GMWI2 δεν έχει σχεδιαστεί για τη διάγνωση συγκεκριμένων ασθενειών, τόνισαν οι συγγραφείς της μελέτης.
Αντίθετα, έχει σκοπό να επισημάνει ανεπαίσθητες αλλαγές στην υγεία του εντέρου ενός ατόμου που μπορεί να υπονοούν ότι είναι πιθανό να αναπτύξουν μια δεδομένη ασθένεια, έγραψαν.
Αντί να παρέχει διαγνώσεις, είπε ο Sung, το εργαλείο θα μπορούσε ενδεχομένως να χρησιμοποιηθεί από άτομα που είναι κατά τα άλλα υγιή αλλά που θέλουν να βελτιστοποιήσουν την υγεία του εντέρου τους για την πρόληψη ασθενειών, είπε.
Μπορεί επίσης να είναι χρήσιμο σε όσους είναι πιο πιθανό να αναπτύξουν μια συγκεκριμένη ασθένεια επειδή εμφανίζεται στην οικογένειά τους, πρότεινε.
Το GMWI2 θα μπορούσε επίσης να χρησιμοποιηθεί για να αξιολογήσει πόσο καλά αναρρώνει το έντερο κάποιου αφού του έχει χορηγηθεί χημειοθεραπεία ή αντιβιοτικά , καθώς και οι δύο αυτές θεραπείες μπορούν να βλάψουν το μικροβίωμα, πρόσθεσε.
Αυτές οι αλλαγές που προκαλούνται από τη θεραπεία μπορούν να αποδυναμώσουν το ανοσοποιητικό σύστημα, καθιστώντας τους ασθενείς πιο ευάλωτους σε μελλοντικές λοιμώξεις .